제가 이번주 발표드릴 논문은 올해 2월 nature immunology에 게재된
"IFNγ and GM-CSF control complementary differentiation programs in the monocyte-to-phagocyte transition during neuroinflammation" 라는 제목의 논문으로 Neuro inflammatio 상황에서 monocyte가 monocyte-derived phagocyte로 분화되는 과정에서 IFNγ와 GM-CSF의 역할을 EAE 모델에서 single cell RNA sequencing을 통해 분석 한 논문입니다.
본 논문에서는 phagocyte로 분화되는 monocyte는 Ly6chi monocyte이며, 이 과정에서 IFNγ는 phagocytic phenotype을 결정짓는 데 관여하며, GM-CSF는 IL-1β의 생성 및 phagocytosis기능, oxidative burst에 관여한다는 사실을 밝혔습니다.
분석 기법들은 많이 생소하여 완벽하게 이해하기에 한계가 있긴하지만,
제 연구 주제와도 밀접한 관계가 있을 뿐만 아니라, scRNA sequencing 데이터 분석 관련해서도 예전부터 흥미를 가지고 있어 어떤식으로 데이터를 해석해나가는지 함께 공부해보면 좋을 것 같아 선정해보았습니다.
열심히 준비하여 토요 세미나 때 뵙겠습니다.
논문 링크: https://www.nature.com/articles/s41590-021-01117-7