안녕하세요, 이번주 발표자 다정입니다.
 
위 논문은 single cell 수준에서 effector/memory CD8 T cell로 분화 중의 transcriptional change에 대하여 연구한 논문입니다.

연구진은 single cell RNA와 transcriptome유래 gene regulatory network 분석을 통해서 naive, SLEC/MPEC, memory CD8 T cell에서의 각각의 주요 regulon을 확인하였으며, 해당 regulon들은 enhancer landscape에 따라 조절 되어 CD8 T cell fate를 결정 짓는다는 것을 확인하였습니다. 

SLEC과 MPEC이 모두 effector시기에는 effector cell로써 비슷한 양상을 가지고 있으며 시간이 경과되면 두가지 타입 모두에서 memory related gene이 손실되지만, MPEC에서는 E2A, TCF7등의 조절을 통하여 인핸서의 접근성이 회복되어 해당 gene들의 re-express가 가능하게 됨을 확인하였습니다. 

더 나아가, E2A를 과발현 시켰을 시 메모리 형성을 유리하게 만듦을 확인하였습니다. 

저도 ATAC seq을 진행하였었는데, 해당 ATAC데이터를 좀 더 다양한 각도에서 분석해보고자 하여 epigenetic 부분을 공부하고자 선정하였습니다.

감사합니다. 

논문 링크 : https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2013452118